《蚌埠医学院学报》（CN：34-1067/R）是一本有较高学术价值的大型月刊，自创刊以来，选题新奇而不失报道广度，服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。

《蚌埠医学院学报》1995年，获全国高等院校自然科学学报（B类）优秀学报三等奖；安徽省高等院校优秀学报二等奖；安徽省优秀科技期刊三等奖。1998年，获安徽省优秀科技期刊三等奖。1999年，获安徽省高等院校优秀学报二等奖。1999～2001年，获安徽省优秀科技期刊三等奖。2004年，获全国高校优秀科技期刊（B类）二等奖和安徽省高校优秀学报二等奖。2005年，学报荣获安徽省优秀科技期刊三等奖；学报编辑部荣获“全国高校科技期刊先进集体”称号。2009年，荣获全国高校科技期刊优秀编辑质量奖，并在安徽省高等学校学报“三优”评比中荣获优秀学报二等奖。